El aeropuerto de Mykonos es la principal puerta de entrada para el chárter de jet privado desde y hacia Mykonos y el único aeropuerto que da servicio a la isla. Situado a unos 4 kilómetros al sureste de la ciudad de Mykonos (Chora), el aeropuerto ofrece un acceso rápido a los principales complejos turísticos, puertos deportivos y beach clubs de la isla. Los traslados a la ciudad de Mykonos duran normalmente unos 10 minutos en condiciones normales de tráfico.
A pesar de la reputación global de la isla como destino de viajes de lujo, el aeropuerto de Mykonos sigue siendo relativamente pequeño y soporta una demanda extremadamente alta durante la temporada de verano. El tráfico de jets privados aumenta de forma considerable entre mayo y septiembre, cuando llegan viajeros desde grandes ciudades europeas como Londres, París, Milán y Zúrich, así como desde Oriente Medio.
El aeropuerto cuenta con una única pista y puede acoger una amplia gama de aeronaves de negocios, entre ellas jets ligeros, jets de tamaño medio y muchas aeronaves de cabina grande. Sin embargo, debido a la longitud de la pista, al terreno y a la congestión estacional, las operaciones en el aeropuerto de Mykonos requieren una planificación cuidadosa, en especial durante los fines de semana de mayor afluencia del verano.
Mykonos es un aeropuerto con coordinación de slots y se requieren slots tanto de llegada como de salida para los vuelos privados. Durante la temporada alta, la disponibilidad de slots puede ser limitada, sobre todo a última hora de la tarde y por la noche, cuando muchas aeronaves llegan antes del atardecer y de la vida nocturna de la isla.
El estacionamiento de aeronaves en el aeropuerto de Mykonos también es limitado. Por ello, muchos jets privados dejan a los pasajeros en la isla antes de reposicionarse en aeropuertos más grandes, como Atenas o aeropuertos cercanos del continente, donde hay estacionamiento nocturno disponible. Después la aeronave regresa para recoger a los pasajeros para la salida.
La meteorología también puede influir en las operaciones. Durante los meses de verano, el Egeo se ve afectado por el Meltemi, un viento estacional del norte que puede influir en las condiciones de los aeropuertos insulares de las Cícladas. Aunque los jets ejecutivos modernos operan con seguridad en estas condiciones, los vientos pueden afectar en ocasiones a la programación y exigir una planificación de vuelo flexible.
Por estos motivos, el aeropuerto de Mykonos sigue siendo uno de los destinos de aviación privada más dinámicos desde el punto de vista operativo del Mediterráneo, en especial en plena temporada de verano.